科學(xué)家：南北豬各異系受基因滲入影響

畜牧編輯

　　作為最早被馴化的動物之一，豬已經(jīng)在近東地區(qū)和中國大量飼養(yǎng)超過1萬年了。這些年以來，在自然選擇和人工選擇的雙重作用下，豬進(jìn)化出了豐富的表型，比如豬會有不同的花色，有肉用豬和寵物豬，而肉用豬還有不同的繁殖能力，不同的生長速度，以及不同的口感等等?？茖W(xué)家們一直很好奇，是怎樣的基因改變導(dǎo)致豬的這些表型變化？其背后的基因機(jī)制到底是怎樣的？

　　來自江西農(nóng)業(yè)大學(xué)，深圳華大基因研究院和美國加利福尼亞大學(xué)的研究人員們通過全基因組測序和選擇性的基因片段分析，對豬的緯度適應(yīng)性機(jī)制進(jìn)行了研究，研究成果于2015年1月27日在線發(fā)表在《自然.遺傳學(xué)》雜志上。

　　據(jù)華大基因?qū)＜医榻B，該研究第一次強(qiáng)調(diào)了基因滲入在豬的不同緯度的適應(yīng)性中的重要作用，為后續(xù)的研究工作，尤其是豬的進(jìn)化研究以及基因滲入在適應(yīng)性進(jìn)化方面的作用，提供了嶄新的視角。

　　在本研究中，研究人員選用了69只不同品種的豬來進(jìn)行基因測序，這些豬代表了11種來自不同地域的品種和3種野生品種，它們分別來自中國的高、低緯度地區(qū)。這不是家豬的第一次基因組學(xué)研究，但卻是第一次使用高深度的全基因組測序?qū)邑i的種群進(jìn)行研究。研究對每只豬的樣本都進(jìn)行了20倍深度的全基因組測序，覆蓋了它們95%的基因組。最后，研究人員共獲得了4100萬個基因變異，其中2100萬個變異是之前的dbSNP數(shù)據(jù)庫中所沒有收錄的。因此，研究人員獲得了一幅近乎完整的豬的基因變異圖譜。在這幅圖譜的指導(dǎo)下，研究人員對家豬與當(dāng)?shù)剡m應(yīng)性有關(guān)的基因變異位點進(jìn)行了全面研究。

　　通過全基因組掃描，研究人員發(fā)現(xiàn)在豬的X染色體上有一段長約14Mb的低重組區(qū)域分別在高緯度和低緯度家豬品種中有顯著性的單體型差異。研究人員認(rèn)為這個片段應(yīng)該與家豬的高、低緯度適應(yīng)性相關(guān)。這是本次研究的一個重大發(fā)現(xiàn)。

　　研究人員還發(fā)現(xiàn)，對于生活在高緯度地區(qū)的家豬品種來說，它們的緯度適應(yīng)性基因片段很有可能來自于另一個豬品種Sus，也就是說，遠(yuǎn)古時代發(fā)生的基因滲入現(xiàn)象在物種的適應(yīng)性進(jìn)化過程中可能發(fā)揮了積極的作用。這是被發(fā)現(xiàn)的第一個種間基因滲入影響家養(yǎng)動物環(huán)境適應(yīng)性的例子，表明不同物種間的基因滲入可能是物種發(fā)生適應(yīng)性進(jìn)化的一個重要基因來源，并且這種基因滲入可以大大加速物種適應(yīng)性進(jìn)化的進(jìn)程。

　　來自華大基因的項目負(fù)責(zé)人毛理凱表示，“我們發(fā)現(xiàn)了許多可能與環(huán)境適應(yīng)相關(guān)的位點。當(dāng)我們在單倍型圖上看到X染色體上有一大片區(qū)域呈現(xiàn)特殊的模式并且與周圍明顯不同時，我們預(yù)感會有重要的發(fā)現(xiàn)?；驖B入將為適應(yīng)性進(jìn)化研究帶來新的視角。”

　　來源： 南方日報

　　（原標(biāo)題：不同緯度的豬 長得不一樣 系受基因滲入影響）